Bartosz Łabiszak

dr Bartosz Łabiszak

Zakład Ekologii Roślin i Ochrony Środowiska > Pracownicy > Bartosz Łabiszak

Stanowisko:

adiunkt

Pokój:

1.23 F

E-mail:

bartosz.labiszak@amu.edu.pl

Tel:

+48 61 829 5746

www:

https://www.researchgate.net/profile/Bartosz-Labiszak

Zainteresowania naukowe

Jestem genetykiem populacyjnym specjalizującym się w badaniach nad historią ewolucyjną, specjacją oraz dynamiką hybrydyzacji gatunków drzew leśnych. Moje badania koncentrują się na analizie przepływu genów i adaptacyjnej zmienności genetycznej zarówno wewnątrz, jak i pomiędzy populacjami drzew, z dużym naciskiem na zastosowanie tej wiedzy w działaniach na rzecz ochrony zagrożonych gatunków. W mojej pracy łączę umiejętności analizy laboratoryjnej i bioinformatycznej, wykorzystując dane genomowe do analizy złożonych wzorców ewolucyjnych oraz dostarczania praktycznych wniosków wspierających ochronę gatunków. Moim głównym językiem programowania jest R, a moje kompetencje obejmują analizę danych sekwencjonowania wysokoprzepustowego, przeprowadzanie analiz genetyki populacyjnej oraz opracowywanie modeli statystycznych służących zrozumieniu różnorodności i struktury genetycznej.

Krótkie CV

2021-obecnie Adiunkt w Zakładzie Ekologii Roślin I Ochrony Środowiska, Wydział Biologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Poznań
2016 –2021 doktorat w Zakładzie Ekologii Roślin I Ochrony Środowiska, Wydział Biologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Poznań
2013-2015: studia magisterkie w Zakładzie Genetyki, Wydział Biologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Poznań

Doświadczenie naukowe

Staż naukowy na Wydziale Biologii UJ w Zespole Genomiki i Ewolucji Eksperymentalnej pod kierunkiem prof. dr hab. Wiesława Babika (01.09.2023-29.02.2024)
2022 Kurs „ Adaptation Genomics”, Physalia, on-line (30.05-03.06.2022)
2022 Kurs „Speciation Genomics”, Physalia, on-line (05.12-09.12.2022)
Kurs „Genome Assembly using Oxford Nanopore Sequencing”, Physalia, Berlin, Niemcy (10-14.02.2020)
Kurs „Podstawy Linux”, Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe, Instytut Chemii Bioorganicznej, PAN, Poznań (08.07.2019)
Warsztaty dendrologiczne podczas II Konferencji Biologia i Ekologia Roślin Drzewiastych, Kórnik-Poznań (11-15.06.2018)
Warsztaty „Podstawy grafiki bitmapowej”, Kursy Dydaktyczne UAM, Poznań (19.02.2018)
Kurs „Numerical Ecology”, Laboratory of Wetland Ecology and Monitoring & Department of Biogeography and Palaeoecology, Wydział Geografii i Geologii, UAM, Poznań, Poland (8 – 14 May 2017)
Warsztaty Biologii Ewolucyjnej, Pracownia Biologii UAM, Wydział Biologii, UAM, Ludwiochowo, Poland (21-25.06.2017)

Projekty badawcze
Testowanie hipotezy ewolucji mitochondrialnego DNA w strefie hybrydyzacyjnej gatunków drzew leśnych z wykorzystaniem złożonych de novo sekwencji genomów. NCN PRELUDIUM 2021/41/N/NZ8/000125 (kierownik)
Rodzima czy obca? Filogeografia kłokoczki południowej Staphylea pinnata L. w Europie Środkowej. NCN PRELUDIUM 2021/41/N/NZ9/02430 (wykonawca)
Ocena struktury genetycznej sosny pospolitej w drzewostanach Roztoczańskiego Parku Narodowego, grant RPN JG-305/2022-UCITT (wykonawca)
Zmienność genetyczna stref hybrydowych i populacji allopatrycznych spokrewnionych gatunków sosen – implikacje w badaniach procesów selekcji, różnicowania ekotypów i gospodarowania naturalnymi zasobami genomowymi. NCN OPUS 2020/39/B/NZ9/00051 (wykonawca)
Rewizja wzorów migracji-selekcji sosny zwyczajnej (Pinus sylvestris L.) z wykorzystaniem nowatorskich podejść genomicznych. NCN – OPUS 2017/27/B/NZ9/00159 (wykonawca)r
Genomika środowiskowa czterech gatunków sosen (rodzaj Pinus) w Europie. NCN OPUS 2015/19/B/NZ9/00024 (wykonawca)

Dydaktyka

Genetyka konserwatorska
Genomika populacyjna
Biotaksonomia
Biotechnologia roślin drzewiastych
Population genomics
Molecular ecology
Basic R programming for scientists
Genomika populacyjna i ewolucyjna

Wybrane publikacje

Łabiszak, B., & Wachowiak, W. (2024). Mid‐Pleistocene events influenced the current spatial structure of genetic diversity in Scots pine (Pinus sylvestris L.). Journal of Systematics and Evolution, 62, 561–576. https://doi.org/10.1111/jse.13013

Szczepański, S., Łabiszak, B., Lasek, M., & Wachowiak, W. (2024). Hybridization has localized effect on genetic variation in closely related pine species. BMC Plant Biology, 24, 1–13. https://doi.org/10.1186/s12870-024-05732-y

Wachowiak, W., Szczepański, S., Lasek, M., Maciejewski, Z., & Łabiszak, B. (2024). Genetic perspective on forest management of Scots pine (Pinus sylvestris L.) in protected areas. Forest Ecology and Management, 568, 1–10. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2024.122127

Szczepański, S., Łabiszak, B., & Wachowiak, W. (2023). Development of a SNaPshot assay for the genotyping of organellar SNPs in four closely related pines. Dendrobiology, 90, 76–85. https://doi.org/10.12657/denbio.090.006

Wachowiak W., Żukowska W., Perry A., Lewandowski A., Cavers S., Łabiszak B.: Phylogeography of Scots pine in Europe and Asia based on mtDNA polymorphisms, Journal of Systematics and Evolution, vol. 61, nr 2, 2023, s. 315-327, DOI:10.1111/jse.12907

Łabiszak B., Zaborowska J., Wójkiewicz B., Wachowiak W.(2019) Molecular and paleo‐climatic data uncover impact of ancient bottleneck on demographic history and contemporary genetic structure of endangered Pinus uliginosa. Journal of Systematics and Evolution, DOI: https:/doi.org/10.1111/jse.12573

Zaborowska J., Łabiszak B., Wachowiak W. (2019) Population history of European mountain pines Pinus mugo and Pinus uncinata revealed by mitochondrial DNA markers. Journal of Systematics and Evolution,
DOI: https:/doi.org/10.1111/jse.12520

Łabiszak B., Zaborowska J., Wachowiak W. (2019) Patterns of mtDNA variation reveal complex evolutionary history of relict and endangered peat bog pine (Pinus uliginosa). AoB Plants, 11(2): plz015.

Wachowiak W., Zaborowska J., Łabiszak B., Perry A., Zucca GM., González-Martínez SC., Cavers S. (2018) Molecular signatures of divergence and selection in closely related pine taxa. Tree Genetics & Genomes, 14:83 [PDF]